MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-P

Total Repeats: 8495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017039	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017039	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017039	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017039	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017039	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017039	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017039	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017039	CT	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017039	TG	4	8	385	392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017039	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017039	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017039	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017039	GA	3	6	721	726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017039	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017039	T	6	6	786	791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017039	T	6	6	836	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017039	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_017039	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_017039	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017039	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017039	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017039	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017039	AC	3	6	2930	2935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017039	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017039	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017039	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017039	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017039	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017039	G	7	7	4391	4397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017039	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017039	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017039	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017039	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017039	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017039	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017039	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017039	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017039	A	6	6	7068	7073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017039	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017039	G	6	6	8364	8369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017039	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017039	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017039	AG	3	6	8452	8457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017039	A	7	7	10480	10486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017039	AGA	2	6	12681	12686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017039	AT	3	6	12696	12701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017039	TAAAG	2	10	13447	13456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017039	CCTA	2	8	13483	13490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017039	ATTG	2	8	14580	14587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017039	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017039	ATT	2	6	15768	15773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017039	GAA	2	6	15817	15822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017039	AAT	2	6	15898	15903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017039	TTA	2	6	15912	15917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017039	TAA	2	6	15929	15934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017039	TTCA	2	8	17757	17764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017039	C	6	6	17769	17774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_017039	TGGG	2	8	17780	17787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017039	G	6	6	17790	17795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017039	C	6	6	17825	17830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_017039	A	6	6	17831	17836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017039	TTG	2	6	20420	20425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017039	TCTT	2	8	20430	20437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017039	A	6	6	20488	20493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017039	A	7	7	20527	20533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017039	TTTG	2	8	20568	20575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017039	GA	3	6	20606	20611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017039	ATT	2	6	21670	21675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017039	TTG	2	6	21743	21748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017039	AAT	2	6	25147	25152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017039	CTC	2	6	25177	25182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017039	AGA	2	6	25203	25208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017039	T	7	7	25214	25220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017039	A	7	7	25238	25244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017039	TAAT	2	8	27865	27872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017039	AT	3	6	27875	27880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017039	GGAC	2	8	27913	27920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017039	T	6	6	27921	27926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017039	TCT	2	6	27960	27965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017039	CTG	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017039	TCA	3	9	29944	29952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017039	CTC	2	6	32460	32465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017039	ATTA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017039	ATA	2	6	33627	33632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017039	TAAAT	2	10	33654	33663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017039	A	6	6	33738	33743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017039	TAA	3	9	33811	33819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017039	ATA	2	6	33828	33833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017039	CTAGG	2	10	33847	33856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017039	AAT	2	6	33863	33868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017039	ATTT	2	8	35532	35539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017039	T	8	8	36628	36635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017039	ATT	2	6	36682	36687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017039	CAT	2	6	36707	36712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017039	ACT	2	6	38564	38569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017039	CCG	2	6	39688	39693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017039	GTT	2	6	39739	39744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017039	CCT	2	6	39745	39750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017039	TCAAAA	2	12	42381	42392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017039	GGA	2	6	43438	43443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017039	TAG	2	6	43504	43509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017039	A	6	6	43528	43533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017039	T	7	7	44935	44941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017039	ATG	2	6	46807	46812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017039	TAAT	2	8	46852	46859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017039	CGA	2	6	46926	46931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017039	ATT	2	6	46971	46976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017039	ATAA	2	8	46981	46988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017039	TAT	2	6	48032	48037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017039	TTG	2	6	48046	48051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017039	T	6	6	48652	48657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017039	GAG	2	6	49870	49875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017039	T	7	7	50233	50239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017039	A	8	8	51901	51908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017039	AAAGA	2	10	51912	51921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017039	AGA	2	6	51926	51931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017039	GGT	2	6	51974	51979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017039	TG	3	6	52033	52038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017039	TGGT	2	8	52124	52131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017039	TAT	2	6	52229	52234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017039	AGT	2	6	52235	52240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017039	TC	3	6	53155	53160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017039	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017039	TTG	2	6	53330	53335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017039	GGT	2	6	53339	53344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017039	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017039	AAT	2	6	53396	53401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017039	GGA	2	6	54152	54157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017039	AG	3	6	54173	54178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017039	CCA	2	6	54224	54229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017039	A	6	6	54307	54312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017039	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017039	ATT	2	6	54342	54347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017039	A	6	6	54354	54359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017039	TAC	2	6	54367	54372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017039	GGA	2	6	54411	54416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017039	GTT	3	9	57234	57242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017039	ATA	2	6	57259	57264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017039	CCCT	2	8	58890	58897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_017039	GGA	2	6	58908	58913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017039	T	7	7	59015	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017039	GTAT	2	8	59658	59665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017039	A	8	8	59675	59682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017039	ATAC	2	8	59700	59707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017039	CTGG	2	8	60458	60465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017039	GGT	2	6	60484	60489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017039	TCT	2	6	61573	61578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017039	TCA	2	6	61598	61603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017039	TC	4	8	61609	61616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017039	ATTT	2	8	61627	61634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017039	ATTT	2	8	61649	61656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017039	ATT	2	6	61684	61689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017039	TTAC	2	8	61715	61722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_017039	ATTA	2	8	61760	61767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017039	TGG	2	6	120035	120040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017039	AATG	2	8	120088	120095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017039	ATTT	2	8	120143	120150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017039	TGA	2	6	120165	120170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_017039	ATT	2	6	209867	209872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017039	GAG	3	9	215165	215173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017039	AACT	2	8	215254	215261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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